红色荧光通道：PI染料通常发出红色荧光信号，因此最常用的通道是红色荧光通道。这些通道通常在约550-650纳米的范围内检测荧光信号。它们通常与荧光显微镜或流式细胞术中的红色滤光片或激光共聚焦显微镜（confocal laser scanning microscopy，CLSM）配合使用。
PI与DNA的结合：PI染料与DNA结合后发出荧光信号，因此常用于DNA染色。PI可以通过与DNA的π-π堆积结构相互作用而结合到DNA双螺旋上。
流式细胞术中的应用：在流式细胞术中，PI染料通常用于区分活细胞和死细胞。它可以通过进入已损伤的细胞膜并与DNA结合来标记死细胞，从而发出荧光信号。
其他应用：除了细胞生物学研究外，PI染料还可以用于DNA凝胶电泳中的DNA染色，以及在组织学和病理学研究中标记细胞核。
总的来说，PI染料主要使用红色荧光通道进行检测和成像，通常用于DNA染色和标记死细胞等应用。在不同的实验设置中，可以根据需要选择适当的荧光通道和检测方法。
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