通常状况下，PVDF膜孔径范围从0.1微米到10微米不，而对应蛋白分子量则可以从几千道尔顿到几百万道尔顿。例如，孔径为0.45微米PVDF膜适合截留分子量约为10,00020,000 Da蛋白质；而孔径为0.22微米膜可以很好阻挡分子量于5,000 Da以上蛋白质。这种选择性过滤特性使得PVDF膜成为实验室、生产中蛋白质提纯理想工具。
另外，PVDF膜还具有较高耐热性、抗污染能力，这使其能够于复杂实验条件下保持稳固表现。通过调整制备工艺参数如铸膜液浓度、凝固浴温度，可以精确控制PVDF膜孔隙结构，从而实现对不同大小蛋白很好分离。和此同时，PVDF膜表面经过特殊处理后还能进一步增强其亲水性，降低非特异性吸附现象有几率，这对于高精度蛋白质检测尤为很大。
合理选用合适孔径PVDF膜对于成功完成蛋白质分离任务至关很大。随着科学技术发展，未来还将有更多新型功能化PVDF材料被开发出来，以满足日益增长很多用途需求。
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