，PEEK价格高昂是其最大短板。因为生产过程复杂且技术门槛高，PEEK树脂成本远高于普通塑料如聚丙烯〔PP〕或聚乙烯〔PE〕。这使得它于一些对成本敏感用途场景中难以普及，例如一次性消费品行业。
PEEK虽然具有优良耐磨性、自润滑性，但于某些极端工况下仍也许表现出不足。比如，于高速重载条件下，其摩擦系数也许会增加，导致磨损加剧。另外，尽管PEEK能够承受较高温度，但长时间处于高温环境会导致材料老化，影响使用寿命。
：PEEK韧性相对较低，于受到强烈冲击时容易有脆裂。因此，于设计要承受动态负载或者冲击载荷部件时，必须充分考虑这一点，并采取相应措施来增强结构强度。
最后，从加工角度来看，PEEK属于热塑性聚合物中“难处理”类型。熔融粘度较高，要求模具含优良导热性以确保均匀冷却；和此同时还要较高注塑压力、精确控制成型条件才能获得理想产品。对于缺乏经验操作人员而言，这无疑增加了生产难度。
上述概括起来虽然聚醚醚酮凭借超强性能成为许多高端用途很好选择，但其高成本、有限韧性还有复杂加工要求也限制了它大量用途范围。企业于选用该材料时应权衡利弊，根据实际需求做出合理决策。
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