，于化学结构上，FEP是由四氟乙烯〔TFE〕、六氟丙烯〔HFP〕共聚而成，这种结构赋予了它优良透明度、较低熔点〔约260℃〕，使其易于加工成型。而PFA则是由四氟乙烯、全氟烷基乙烯基醚共聚而成，其分子链更长且无支链，因此拥有更高熔点〔约305℃〕还有更好耐蠕变性、耐溶剂性。
从机械性能来看，PFA比FEP更坚韧、强度更高，和此同时含更好抗拉伸性、耐磨耗性。这使得PFA更适合用于要承受较大应力或长时间使用场合，如化工管道内衬；而FEP则因其柔软易加工特点，于薄壁制品及复杂形状零件生产中更具优势。
于用途行业方面，因为FEP具有突出光学透明度、较低成本，被用来生产电线电缆护套、元件外壳还有医疗设备部件；而PFA凭借超强耐高温、耐腐蚀特性，则大量用途于半导体工业中晶圆处理系统、制药行业里反应釜衬里行业。
虽然FEP和PFA同属性能很好工程塑料家族，并且各自都显现了特殊优点，但于具体选择时还需根据实际需求权衡二者之间差异。
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